他サイトから大量のリンクを貼られてしまい、自分のサイトがスパム扱いされ、検索順位が落ちてしまうケースがあります。
不自然な被リンクが大量にあると、検索エンジンがスパムと判定してしまうため、そのサイトの評価を落とすわけです。
逆SEOとも言われています。
ただ、調べてみた結果、どうやら一時的な事のようで、しばらく経つと順位が戻るようです。
最近Googleから、サイトへの不自然なリンクを否認するツールの提供が開始されました。
これを使ったからOKというわけではないですが、不正リンクなどで警告を受けたが対処できない場合などは検討してみるとよいかと思います。